AHF работает в Эстонии с начала 2009 года при поддержке Эстонской сети людей, живущих с ВИЧ (EHPV). Благодаря партнерству люди, живущие в районах, наиболее пострадавших от эпидемии, могут пройти быстрое тестирование на ВИЧ, получить бесплатные презервативы и направления к поставщикам медицинских услуг в случае положительного результата теста.

В 2013 году AHF и EHPV открыли клинику по лечению ВИЧ в эпицентре эпидемии, Нарве, городе, серьёзно пострадавшем от сочетания социально-экономической депрессии и широкого распространения наркомании. Эта клиника стала первой клиникой AHF в ЕС и также является местом встречи групп поддержки для людей, живущих с ВИЧ.

В последние годы Эстония добилась значительного прогресса в борьбе с ВИЧ на национальном уровне. Распространенность ВИЧ стабилизировалась, но новые случаи продолжают регистрироваться каждый год. Сегодня большинство новых случаев ВИЧ регистрируется в Харьюмаа, особенно в столице, Таллинне, за которым следует Ида-Вирумаа. Этот сдвиг подчёркивает меняющийся характер эпидемии и необходимость поддержания широкого доступа к услугам профилактики и тестирования.

Для решения этой проблемы в конце 2024 года AHF Estonia расширил свои услуги, открыв пункты регулярного тестирования на ВИЧ в Таллинне. Эти пункты тестирования на базе местных сообществ предлагают бесплатное и конфиденциальное тестирование на ВИЧ, а также факультативное обследование на сифилис и гепатит B/C. Услуги тестирования сопровождаются бесплатной раздачей презервативов и информационными кампаниями.

Доступ к антиретровирусной терапии (АРВ) полностью поддерживается правительством Эстонии, и лечение доступно всем людям, живущим с ВИЧ, через национальную систему здравоохранения.

Несмотря на то, что в Эстонии охват тестированием и лечением достаточен, социальная стигматизация и недостаточная осведомлённость по-прежнему препятствуют ранней диагностике. AHF Estonia по-прежнему привержена работе с общественностью, укреплению партнёрских отношений и обеспечению доступности профилактических средств, включая презервативы, обучение и тестирование, для всех.