Мир опасно отстает в отслеживании появления новых вариантов COVID-19 из-за того, что не может достаточно быстро масштабировать геномное секвенирование новых случаев, чтобы отслеживать мутирующий вирус. Фонд AIDS Healthcare (AHF) призывает страны сотрудничать и взять на себя обязательство по достижению глобальной цели по секвенированию не менее 5% всех случаев COVID-19 и последовательному представлению результатов в течение недели.
По данным Глобальной инициативы по обмену данными о птичьем гриппе (GISAID), крупнейшей глобальной платформы с открытым доступом, которая отслеживает геномное секвенирование SARS-CoV-2, в настоящее время только около 1.5% всех случаев были секвенированы и зарегистрированы в GISAID. В то время как в нескольких странах дела обстоят хорошо, например, в Австралии и Исландии секвенировано 58.6% и 57% случаев соответственно, в большинстве стран этот показатель значительно ниже 5%, включая многие развитые и промышленно развитые страны. Что еще хуже, большинство отчетов, поступающих в GISAID, безнадежно устарели: в среднем с момента сбора данных странам требуется почти 78 дней, чтобы отправить их в GISAID. С задержкой отчетности более 2.5 месяцев такие старые данные серьезно подрывают усилия по реагированию на постоянно меняющийся вирус.
«Геномное секвенирование имеет критически важное значение, поскольку мы, вероятно, наблюдаем развитие эпидемиологической картины со значительной задержкой — доступные сейчас данные представляют собой снимок того, что происходило месяц назад или даже раньше», — сказал президент AHF Майкл Вайнштейн . «Если, например, новый вариант появляется прямо сейчас на Ямайке, в Перу или Украине, мы узнаем об этом только в следующем месяце. Это вопрос глобальной безопасности здравоохранения, и Соединенные Штаты могут сыграть важную ведущую роль в геномном секвенировании, активизировав эти усилия внутри страны и помогая другим странам делать то же самое. Без своевременных глобальных данных геномного секвенирования мы действуем вслепую и воюем по вчерашним правилам».
AHF начал финансирование проектов геномного секвенирования через свой Глобальный институт общественного здравоохранения в Университете Майами, чтобы продемонстрировать, как такая модель может быть развернута быстро и эффективно. С момента запуска в начале этого года инициатива вышла за пределы Майами. В ответ на запрос предложений по геномному секвенированию AHF получила заявки от Мексики, Аргентины, Бразилии, Уганды, Кении, Индии, Тринидада и Тобаго и Таиланда, а также выражения заинтересованности от Ямайки, Филиппин и Украины.
«Мы финансируем проекты по секвенированию генома, чтобы показать, что мы не только говорим об этом и требуем более активных действий, но и делаем это. Одним из требований для получения грантов от AHF является предоставление данных в GISAID, чтобы каждый человек во всем мире мог воспользоваться этими знаниями», — сказал доктор Хорхе Сааведра , исполнительный директор Института глобального общественного здравоохранения AHF при Университете Майами.
Профессор Марио Стивенсон, известный вирусолог из Университета Майами и один из получателей гранта AHF, охарактеризовал важность отслеживания новых вариантов SARS-CoV-2 как способа узнать своего врага. «Лучший способ бороться с врагом — знать врага изнутри. Геномное секвенирование позволяет нам точно знать, как меняется коронавирус, как он может развиваться и атаковать, и является ли это вариантом, вызывающим озабоченность, или вариантом, представляющим интерес, за которым следует внимательно следить», — сказал профессор Стивенсон.
